自二十世纪以来，人类对宇宙的探索脚步始终未曾停歇。

早在1969年，人类便实现了登陆月球。如今，经多个大国数十年不间断的努力，最新一期的NS-5月球国际基地已接近竣工。多个太阳能与核能发电站的建立意味着月球基地长期驻扎大量人员成为可能，基地功能也将不再局限于科考、勘探、补给等作业，而真正具备了防卫功能及外太空轨道打击能力，使新时代的战略威慑武器翻入太空篇章。

国联总部一片欢欣之际，头悬利剑的安盟正秘密谋划着针对月球基地的入侵计划。很快，Ghost部队的卧底特工传来了安盟所属航天基地即将发射航天飞机的紧急情报。

在此次针对月球的行动中，安盟派遣了最精锐的Ghost女性指挥官卡莉及其亲卫队携带着新型病毒【QUEEN】出征，该病毒可在大幅强化试验体生理机能的同时，还暂时保留其意识与记忆。疯狂的安盟企图通过病毒感染的方式颠覆整个月球基地！

英雄辈出的国联特战小队，是否还能勇闯敌巢力挽狂澜？这一切，全都掌握在你的手中！